大正十四年(西元1925年)一月,地方士紳聚會,深以臺北市無孔廟為憾,在座有人願意捐獻私地,當日即決定重建孔廟。 沒多久舉行重建孔廟協商會議,決定建築及募款方式。士紳捐獻田地,合為約五千坪作為建廟基礎,聘請唐山師父來設計建造。
民國三十五年(西元1945年),因經費無著,祭典暫停。 到民國三十五年(西元1946年),官民為了恢復孔誕祭典,公議復興臺北崇聖會,主持每年孔誕祭典,到民國三十九年(西元1950年),為孔子誕生二千五百年紀念,特別擴大舉行,當時蔣中正先生特別敬獻手書匾額「有教無類」, 民國四十年(西元1951年),相關人士決定組織臺北孔子廟管理委員會,推動平常事務及每年祭典事宜,民國四十九年(西元1960年),有鑑於尊孔重道乃是國家大政,再加上孔廟的維護費支出龐大,乃決議將孔廟捐給政府。民國六十年(西元1971年),行政院核定臺北孔廟由臺北市政府管理,民國六十一年(西元1972年)七月,正式成立「臺北市孔廟管理委員會」,隸屬民政局,由民政局長兼主任委員。